S pojavom probiotikov, ki se prodajajo kot dodatki za zdravje, je postalo običajno, da se bakterije v črevesnem traktu imenujejo kot "dobre" bakterije ali "slabe" bakterije. Povprečna oseba ima v črevesju okoli 100 bilijonov bakterij, v skladu s Harvard Medical School Guide Family Health Guide. "Dobre" bakterije opravljajo številne potrebne funkcije v črevesnem traktu. Nekatere "slabe" bakterije ne povzročajo nobenih težav, dokler njihova številka ostane nizka, a vas lahko ozdravi, če pomnožijo ali potujejo v druge dele telesa.
Premagovanje slabih bakterij
Dobre bakterije pomagajo ohranjati slabe bakterije pri razmnoževanju in povzročanju bolezni na več načinov. Uporabljajo hranila, tako da slabo bakterije nimajo dostopa do njih. Laktobacili, ki jih najdemo predvsem v tankem črevesu, in Bifidobacteria, ki se nahajajo predvsem v debelem črevesu, ohranjajo kislo okolje v črevesju s proizvodnjo mlečne kisline, vodikovega peroksida in ocetne kisline. Kislinsko okolje odvrača rast slabih bakterij. Dobre bakterije okrepijo tudi sluznično tkivo, ki usmerja notranjost črevesja, zaradi česar je za toksine težje pridobiti toaleto in začeti prebivati.
Prehranska hranila
Prehrana hrane je odvisna od delovanja dobrih bakterij, ki razgrajujejo zapletene sladkorje, beljakovine in maščobe, da vaše telo absorbira svojo energijo. Laktobacili, prevladujoči mikroorganizmi, najdeni v tankem črevesu, razgrajujejo beljakovine in laktozo, ki jo najdemo v mlečnih izdelkih in holesterol za absorpcijo.
Sintetiziranje vitaminov
Nekatere bakterije tudi sintetizirajo vitamine. Lactobacillus acidophilus proizvaja vitamin K. Laktinske kisline bakterije proizvajajo nekatere vitamine B-kompleksa, medtem ko enterična bakterija proizvaja vitamin B-12.
Pomoč pri imunskem sistemu
Dobre bakterije igrajo pomembno vlogo pri podpiranju imunskega sistema. Ena vrsta Lactobacillus, L. caseii, proizvaja bakteriocine, spojine, ki omejujejo rast škodljivih bakterij v tankem črevesju. Dobre bakterije zvišujejo bele krvne celice, imenovane T-celice, ki pomagajo pri odzivu imunskega sistema na škodljive bakterije. Pregled razpoložljivih študij, ki jih je izvedel Zdravstveni sistem Puget Sound, ki je bil objavljen v izdaji "The American Journal of Gastroenterology" aprila 2006, je pokazala, da lahko probiotiki, ki so sestavljeni iz "dobrih" bakterij, skrajšajo trajanje driske po dajanje antibiotikov in okužb s Clostridium difficile.
