Po podatkih Svetovne zdravstvene organizacije je bakterija salmonela eden najpogostejših vzrokov bolezni pri prehranjevanju po svetu. V ZDA 1,4 milijona okužb vsako leto povzroči več kot 150.000 obiskov zdravnikov, 15.000 hospitalizacij in 500 smrtnih primerov. Čeprav zastrupitev s salmonelo ponavadi povzroča blag, samozadosten gastroenteritis ("salmoneloza"), se lahko v nekaterih primerih pojavijo tudi dolgoročni učinki.
Metastatske okužbe
V redkih primerih salmonela uide v črevesje, da vstopi v krvni obtok. Okužba krvnega obtoka je sama po sebi smrtna in lahko povzroči dolgotrajne zaplete, ko se salmonela razširi (metastazira) iz krvnega obtoka, da okuži druga področja telesa. Primeri metastatskih okužb salmonele vključujejo okužbo srčnih zaklopk in obloge srca (endokarditis), kost (osteomielitis), ledvice (pielonefritis) in druga mehka tkiva, vključno z možgani. Značilno je, da se te okužbe počasi razvijajo in da se pojavijo veliko dlje kot 12 do 72 ur, povezanih s klasičnim salmonelnim gastroenteritisom. Redko se pojavijo pri zdravih odraslih in so veliko bolj pogoste pri ljudeh z ogroženim imunskim sistemom (kot so tisti s AIDS-om, rakom, anemija srpastih celic) ali več zdravstvenih težav.
Avtoimunska bolezen
Po izpostavljenosti salmoneli imunski sistem povzroča protitelesa proti bakterijam. Na žalost bakterije salmonele spominjajo na celični marker, ki je prisoten pri mnogih ljudeh. Rezultat je avtoimunska bolezen, ki povzroča Reiterjev sindrom, ki povzroča kronično bolečino v sklepih (artritis), draženje oči (konjunktivitis z ali brez iritisa) in težave z uriniranjem (uretritis). V raziskavi iz leta 2001, predstavljeni v reviji Clinics in infectious diseases, je skoraj tretjina ljudi, okuženih z Salmonella Dnteridis, eno izmed najpogostejših vrst salmonele, razvila artritis, ki je vztrajala do 6 mesecev, in skoraj 50 odstotkov poročalo o ponovitvi po končani začetni epizodi.
Kronični prevozniki
V nekaterih primerih posamezniki opomorejo zaradi okužbe s salmonelo in postanejo kronični nosilci. Najbolj znan primer humanega kroničnega nosilca salmonele je "Typhoid Mary". J.W. Leavittova knjiga iz leta 1996 "Typhoid Mary: Captive to Public Health" opisuje pravo zgodbo asimptomatskega irsko-ameriškega kuharja, povezanega s 54 primeri in štirimi smrtmi v devetih različnih epidemijah tifusne mrzlice v začetku 20. stoletja v New Yorku.
Danes se kronična stanja nosilcev ponavadi lahko izkoreninijo z razširjenim potekom antibiotikov, čeprav so lahko posamezniki omejeni na vrsto dela, ki ga lahko opravljajo v vmesnem času. Večina kroničnih nosilcev je asimptomatična. Vendar pa lahko bolniki z aidsom in drugimi vrstami imunskega kompromisa ponovijo ponavljajoče se ponovitve, preden so antibiotiki učinkoviti.
